BMCBiology

食蚜蝇(Eupeodescorollae)基因组：虫豸捕食和授粉的退化

年7月6日，BMCBiology在线颁发华夏农业科学院植物爱护钻研所吴孔明院士团队的题为GenomeofthehoverflyEupeodescorollaeprovidesinsightsintotheevolutionofpredationandpollinationininsects的文章。

本文首要建立了食蚜蝇(Eupeodescorollae)的高品质基因组，并从捕食和授粉的退化上供应了新的观点，是推动对食蚜蝇和其余天敌的遗传适响应退化钻研的贵重资本。

L9Pjx8AbstractBackground

包含Eupeodescorollae在内的食蚜蝇(Diptera:Syrphidae)是全国上紧要的虫豸，它供应两复活态系统效劳，包含害虫节制和授粉。其幼虫是蚜虫的首要捕食者，可做为生物节制剂，其成虫是高效的授粉者。幼虫和成虫的不同取食习惯使食蚜蝇成为相识虫豸捕食和授粉的退化和适应机制的贵重遗传资本。

本文建立了基因组巨细为Mb的食蚜蝇E.Corollae高品质参考基因组，它具备蚜虫捕食者和授粉者的特征。E.corollae和Coccinellidae（瓢虫，蚜虫捕食者）的对比基因组解析揭穿了基因，这些基因参加日夜节奏和取食动做，也许以日夜节奏的方法调治E.corollae的取食动做。与E.Corollae的能量临盆相关的糖合成器和脂质输送的基因在传粉者蜜蜂中有同源基因，在捕食性瓢虫中没有。一些典范的细胞色素P解毒基因，主若是CYP6亚家眷成员，在E.Corollae中被扩增。值得提防的是，对E.corollae和其余食蚜蝇的对比基因组解析优异了三个同源的胰卵白酶（Ecor,Ecor,Ecor）。转录组解析讲明，包含Ecor、Ecor和Ecor在内的9个胰卵白酶在幼虫阶段猛烈表白，而参加视觉感知的10个卵白酶基因在E.Corollae的成虫阶段显著上调。

ResultsGenomeassemblyandannotationofE.corollae

测序数据：60.23Gb二代Illuminareads+65.77GbPacBioCLR+55.42GbHi-C

组装办法：Wtdbg2+Canu+ALLHiC

基因组巨细：Mb；contigN50：1.8Mb；染色体数量：4

组装品质评价：

mappingrateof98.14%andacoveragerateof97.82%

97.1%ofthe

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